Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col2a1P28481 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms