Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms