Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms