Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U2af2P26369 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms