Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CftrP26361 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CftrP26361 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CftrP26361 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CftrP26361 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CftrP26361 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CftrP26361 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms