Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmo2P25801 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo2P25801 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms