Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsta3P23591 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms