Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RarbP22605 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RarbP22605 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms