Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms