Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms