Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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