Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms