Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms