Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrphP15331 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrphP15331 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrphP15331 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrphP15331 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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PrphP15331 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PrphP15331 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrphP15331 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrphP15331 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrphP15331 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrphP15331 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrphP15331 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PrphP15331 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PrphP15331 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms