Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms