Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms