Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P10404 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P10404 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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