Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ly6c1P0CW02 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms