Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms