Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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