Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P04212 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P04212 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P04212 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P04212 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P04212 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P04212 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P04212 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P04212 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P04212 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P04212 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P04212 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P04212 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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