Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BlmO88700 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BlmO88700 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
BlmO88700 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BlmO88700 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BlmO88700 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BlmO88700 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BlmO88700 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BlmO88700 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms