Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms