Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx2O70340 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx2O70340 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx2O70340 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx2O70340 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx2O70340 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms