Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms