Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1bO70237 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms