Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3dO70194 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms