Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cbx4O55187 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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