Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms