Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CrxO54751 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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