Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FxnO35943 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FxnO35943 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FxnO35943 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FxnO35943 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FxnO35943 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FxnO35943 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FxnO35943 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FxnO35943 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FxnO35943 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FxnO35943 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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