Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Opn1mwO35599 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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