Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk2O35491 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Clk2O35491 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Clk2O35491 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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