Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TnxbO35452 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TnxbO35452 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms