Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx2O08686 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms