Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MttpO08601 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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MttpO08601 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MttpO08601 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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MttpO08601 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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