Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tcrg-C3L7N479 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tcrg-C3L7N479 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms