Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms