Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms