Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms