Protein–RNA interactions for Protein: J3QPR6

Rfpl4b, MCG1377, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfpl4bJ3QPR6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfpl4bJ3QPR6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms