Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm933J3QPC1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms