Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4930544D05RikJ3QK56 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms