Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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