Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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