Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms