Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Usp9yF8VPU6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms