Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms