Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms