Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms